Одним из преимуществ ионообменных смол является способность удалять из воды и тяжелые цветные металлы, радионуклиды, а также присутствующие в водной фазе в растворенном состоянии железо (II) и марганец (II). Однако, на практике возможность использования катионообменных смол сильно затруднена. Объясняется это следующими причинами: применение катионитов целесообразно для растворов с повышенной жесткостью. В этом случае железо (II) удаляется из воды вместе с кальцием и магнием. Для воды с небольшой жесткостью применение катионитовых смол нерационально. Ионообменные смолы очень «чувствительны» к наличию железа (III), которое ?забивает? смолу и очень плохо из нее вымывается. В присутствии растворенного кислорода происходит переход Fe2+ в Fe3+, что усиливает вероятность образования нерастворенного железа (III) в фазе смолы. При этом быстро уменьшается ионообменная емкость смолы, что требует более частой ее регенерации. Наличие в воде органических веществ (в том числе органических комплексов железа) может привести к быстрому «зарастанию» смолы органической пленкой, которая одновременно служит питательной средой для бактерий.
Таким образом, применение, ионообменных смол с целью выделения из воды тяжелых металлов требует предварительной очистки воды от железа и органических веществ. Предварительная мембранная фильтрация лишь частично решает эту проблему. Кроме того, некоторые ионообменные смолы недостаточно селективны по отношению к радионуклидам. На фоне повышенного содержания солей степень их извлечения с помощью ионообменных смол невелика.
Применение в качестве предварительной ступени очистки инертных материалов не обосновано ввиду низкой эффективности процесса, которая сводится лишь к улучшению органолептических свойств, в основном мутности. Применение активированных углей нерационально в силу высокой стоимости предочистки.